一、臨床基因擴(kuò)增檢驗實驗室區(qū)域設(shè)置原則
(一) 臨床基因擴(kuò)增檢驗實驗室原則上分為四個分隔開的工作區(qū)域:
1、試劑貯存和準(zhǔn)備區(qū)
2、標(biāo)本制備區(qū)
3、擴(kuò)增反應(yīng)混合物配制和擴(kuò)增區(qū)
4、擴(kuò)增產(chǎn)物分析區(qū)
如使用全自動分析儀,區(qū)域可適當(dāng)合并。
(二)各工作區(qū)域須有明確的標(biāo)記,避免不同工作區(qū)域內(nèi)的設(shè)備、物品混用。
(三)進(jìn)入各工作區(qū)域須嚴(yán)格按照單一方向進(jìn)行,即試劑貯存和準(zhǔn)備區(qū)→標(biāo)本制備區(qū)→擴(kuò)增反應(yīng)混合物配制和擴(kuò)增區(qū)→擴(kuò)增產(chǎn)物分析區(qū)。
(四)不同的工作區(qū)域使用不同的工作服(例如不同的顏色)。工作人員離開各工作區(qū)域時,不得將工作服帶出。
二、工作區(qū)域儀器設(shè)備配置標(biāo)準(zhǔn)
(一)試劑貯存和準(zhǔn)備區(qū)
1、2~8℃和-15℃冰箱
2、混勻器
3、微量加樣器(覆蓋l~1000ul)
4、移動紫外燈(近工作臺面)
5、消耗品:一次性手套、一次性吸水紙、耐高壓處理的離心管和加樣器吸頭(帶濾心)
6、專用工作服和工作鞋
7、專用辦公用品(二)標(biāo)本制備區(qū)
1、2~8℃冰箱、-20℃或-80℃冰箱
2、高速臺式冷凍離心機(jī)
3、混勻器
4、水浴箱或加熱模塊
5、微量加樣器(覆蓋1~1000ul)
6、可移動紫外燈(近工作臺面)
7、超凈工作臺
8、消耗品:一次性手套、一次性吸水紙、耐高壓處理的離心管和加樣器吸頭(帶濾心)
9、專用工作服和工作鞋
10、專用辦公用品 如需處理大分子DNA,應(yīng)備有超聲波水浴儀。(三)擴(kuò)增反應(yīng)混合物配制和擴(kuò)增區(qū)
1、 核酸擴(kuò)增儀
2、 微量加樣器(覆蓋1~1000ul)
3、 可移動紫外燈(近工作臺面)
4、 消耗品:一次性手套、一次性吸水紙、耐高壓處理的離心管和加樣器吸頭(帶濾心) 5、專用工作服和工作鞋
6、專用辦公用品
PCR實驗室建設(shè)四要素
1 試劑準(zhǔn)備區(qū)
用于試驗試劑的準(zhǔn)備。該區(qū)域為正壓,目的是防止污染物質(zhì)溢入。該區(qū)域內(nèi)部又可分為3個區(qū)域:普通提取試劑的準(zhǔn)備區(qū)、PCR試劑準(zhǔn)備區(qū)和PCR主反應(yīng)液準(zhǔn)備區(qū)。在普通提取試劑的準(zhǔn)備區(qū)內(nèi)準(zhǔn)備一些樣品核酸提取時所需的裂解液、提取液等;PCR試劑準(zhǔn)備區(qū)用于PCR試劑的制備和保存。例如準(zhǔn)備引物、探針等PCR試劑。為了防止交叉污染,避免反復(fù)冷凍和解凍,試劑存貯溶液應(yīng)該被平均為小的工作體積,儲存在這個房間以備后用:PCR主反應(yīng)液準(zhǔn)備區(qū)將進(jìn)行主反應(yīng)混合液(除了樣品。所有PCR所需試劑的混合)添加到PCR管的操作。重要提示:不能將其它房間的材料(包括擴(kuò)增、模板和目標(biāo)核酸或陽性對照、供應(yīng)品、或設(shè)備)帶進(jìn)試劑準(zhǔn)備區(qū)。
2 樣品準(zhǔn)備區(qū)
該區(qū)域無壓力設(shè)置要求。該區(qū)域是用于對樣品進(jìn)行分樣,將樣品進(jìn)行研磨、粉碎、勻漿的區(qū)域。由于在這些粉碎、研磨和勻漿處理過程中會產(chǎn)生氣溶膠,因此,存在陽性樣品污染后續(xù)操作的可能性。該區(qū)域與后面的區(qū)域應(yīng)嚴(yán)格隔離,應(yīng)放在與后面的三個區(qū)域隔開的獨(dú)立的房間中。在樣品準(zhǔn)備區(qū)內(nèi)還可設(shè)立一個專用的封閉區(qū)或房間用于樣品的接收和儲存。這個房間可以放置冰箱用于樣品儲存,應(yīng)該和樣品準(zhǔn)備區(qū)其它區(qū)域隔離開。樣品準(zhǔn)備區(qū)域的人員不得進(jìn)入試劑準(zhǔn)備區(qū)。
3 核酸提取區(qū)
核酸提取區(qū)是進(jìn)行樣品核酸提取的區(qū)域。該區(qū)域為負(fù)壓,目的是防止核酸溢出造成污染。樣品準(zhǔn)備區(qū)又包括從樣品中進(jìn)行核酸提取和純化的區(qū)域以及將核酸加到包含PCR主反應(yīng)混合液管中的操作區(qū)域。添加完樣品后,PCR管的蓋子要盡可能快地蓋好。使用PCR板和膠蓋時,陽性對照和含目標(biāo)序列的樣品要與待測樣本分開操作,以避免模板添加時造成交叉污染
重要提示:這個房間里的一切物品不得帶入試劑準(zhǔn)備區(qū)。
4 擴(kuò)增和產(chǎn)品檢測區(qū)
該區(qū)域是用來進(jìn)行PCR擴(kuò)增和PCR分析的。PER儀放置在這個區(qū)域。房間保持負(fù)壓,目的是防止核酸溢出。在該區(qū)域人員一定要一直穿戴工作服
和手套,在離開房間前脫去,防止擴(kuò)增子污染其它地點(diǎn)。所有用于擴(kuò)增和產(chǎn)品檢測的設(shè)備要指定用于這個房間。PCR分析]二作也設(shè)置在該區(qū)域,例如:酶切、測序、克隆等,但實驗室應(yīng)盡可能把這些活動分隔在不同區(qū)域或不同房間。以降低擴(kuò)增產(chǎn)物的污染風(fēng)險。如果沒有條件在該區(qū)域設(shè)立負(fù)壓,此區(qū)域須建立排風(fēng)裝置。
重要提示:這個房間的物品不能帶入樣品準(zhǔn)備區(qū)或試劑準(zhǔn)備區(qū)。
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